آزمایش Zika RT-PCR یک روش تشخیصی مولکولی بسیار دقیق است که برای شناسایی ژنوم RNA ویروس زیکا در نمونههای بالینی (مانند خون، ادرار، مایع مغزی-نخاعی یا بافت) در مراحل اولیه عفونت طراحی شده است. این آزمایش با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز رونوشت بردار معکوس (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)، ابتدا RNA ویروس را به DNA مکمل (cDNA) تبدیل کرده و سپس قطعات اختصاصی ژنومی ویروس را به صورت نمایی تکثیر میکند تا امکان تشخیص حتی مقادیر بسیار کم ویروس فراهم شود. حساسیت این آزمایش در ۵ تا ۷ روز اول پس از بروز علائم (مانند تب، راش پوستی، درد مفاصل) به اوج میرسد و به عنوان استاندارد طلایی برای تأیید عفونت حاد زیکا محسوب میشود، به ویژه به دلیل توانایی آن در تمایز بین ویروسهای مشابه مانند دنگ و چیکونگونیا. نتایج معمولاً در عرض چند ساعت تا یک روز آماده میشوند و برای تأیید نهایی اغلب نیاز به بررسی توسط آزمایشگاههای مرجع سلامت عمومی (مثل CDC یا WHO) وجود دارد.