در آزمایش Monkeypox برای تشخیص آبله میمون از روش PCR (واکنش زنجیره‌ای پلیمراز) به عنوان استاندارد طلایی استفاده می‌شود. نمونه‌گیری معمولاً از مایع یا پوسته ضایعات پوستی (تاول‌ها، جوش‌ها یا دلمه‌ها) انجام می‌گیرد، چرا که این ضایعات حاوی مقدار زیادی ویروس هستند. نمونه‌های دیگر مانند خون، ادرار یا سواب گلو نیز ممکن است استفاده شوند، اما حساسیت کمتری دارند. زمان مناسب آزمایش هنگام وجود ضایعات فعال است، زیرا آزمایش در مراحل اولیه عفونت یا پس از بهبودی ممکن است نتیجه منفی کاذب (جواب آزمایش منفیِ اشتباه) بدهد. این آزمایش‌ها عمدتاً در آزمایشگاه‌های تخصصی انجام می‌شوند و نتایج معمولاً ظرف چند روز آماده می‌گردند. تشخیص سریع برای کنترل شیوع، شروع درمان حمایتی و پیشگیری از انتقال ویروس حیاتی است.